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北京百泰派克生物科技有限公司
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優化PRM定量蛋白質組學,實現高靈敏度低

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產品型號

品       牌百泰派克

廠商性質其他

所  在  地北京市

更新時間:2025-05-25 10:34:04瀏覽次數:36次

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優化PRM定量dànbáizhì組學,實現高靈敏度低豐度蛋白檢測檢測技術服務: 在疾病早篩、生物標志物驗證及藥物靶點發現等研究中,低豐度蛋白的jīngzhǔn檢測一直是dànbáizhì組學領域的核心挑戰。并行反應監測(Parallel Reaction Monitoring, PRM)技術,憑借其出色的定量準確性和特異性,正在成為靶向dànbáizhì組學研究的主流策略。通過系統優化PRM策略,

優化PRM定量蛋白質組學,實現高靈敏度低豐度蛋白檢測檢測技術服務詳情介紹

在疾病早篩、生物標志物驗證及藥物靶點發現等研究中,低豐度蛋白的jīngzhǔn檢測一直是dànbáizhì組學領域的核心挑戰。并行反應監測(Parallel Reaction Monitoring, PRM)技術,憑借其出色的定量準確性和特異性,正在成為靶向dànbáizhì組學研究的主流策略。通過系統優化PRM策略,科學家們正不斷突破檢測靈敏度的極限,推動低豐度蛋白的高質量定量分析。


一、PRM技術原理

PRM是一種基于高分辨率質譜(如Orbitrap)平臺的靶向定量方法,與多反應監測(MRM)相比,其無需預先選擇碎片離子,可同時監測目標肽段的所有產物離子,極大提升了定量的特異性與通量。


二、PRM的核心優勢

→ 高選擇性:借助高分辨率、高精度的質譜平臺,有效區分同分異構體或背景干擾信號;

→ 高通量兼容性:支持多靶點并行監測,適用于復雜樣本的多標志物分析;

→ 簡化方法開發:不同于MRM需優化多個過渡離子,PRM方法建立更為高效、穩定。

然而,在應用PRM檢測低豐度蛋白時,依舊面臨諸如信號弱、離子抑制效應、肽段選擇不當等諸多技術難題。


優化策略一:前處理流程精細化,提升靶肽富集效率

低豐度蛋白常常埋藏在高豐度背景(如白蛋白、免疫球蛋白)中,前處理效率直接決定其能否被成功捕獲。當前,提升樣本準備環節的富集效果,已成為優化PRM定量的關鍵前提。

※ 常見優化手段包括:

→ 高豐度蛋白去除(HAP depletion):采用免疫親和柱或磁珠法選擇性去除血清/血漿中的高豐度成分;

→ 目標蛋白富集技術:如免疫沉淀(IP)、親和捕獲或磁珠結合肽段選擇技術(SISCAPA);

→ 微量樣本預處理平臺:利用微流控芯片、自動化平臺減少樣本損耗,提升靶標回收率。


優化策略二:肽段篩選與標準品設計的科學性

PRM定量依賴于對特異性肽段的jīngzhǔn識別與監測。若靶肽在酶切效率、離子化能力或保留時間等方面表現欠佳,容易導致定量偏差。

※ 優化肽段選擇的原則包括:

→ 肽段應wéiyī對應目標蛋白,無同源性干擾;

→ 應避免含有修飾位點、易氧化的氨基酸(如Met、Cys);

→ 應具備良好的MS響應、穩定的保留時間和酶切效率。

此外,采用穩定同位素標記肽段(SIS peptides)作為內標,可顯著提升定量準確性,尤其是在復雜背景下的低豐度蛋白分析中發揮作用。


優化策略三:質譜參數調優與儀器平臺選擇

質譜參數設置是決定PRM靈敏度的“zuì后一公里"。合理優化采集窗口、碰撞能量(CE)和離子積累時間(IT),有助于強化目標信號、抑制背景干擾。

※ 常見優化方向包括:

→ 采集窗口精細化:縮短或錯開監測窗口,避免信號重疊;

→ 增強離子聚集時間:適度延長IT以增強信號,但需平衡采樣周期;

→ 多級篩選精度調節:在Orbitrap平臺上調節分辨率與掃描速度的權衡,提升數據質量。


優化策略四:數據分析算法賦能,jīngzhǔn挖掘低信號

對于低豐度信號的提取與判別,傳統分析軟件易受干擾峰影響而產生假陽性或漏報。借助人工智能與深度學習算法的新一代數據處理平臺,正在為PRM數據賦予更強的靈敏度與可重復性。

※ 例如:

→ Skyline軟件支持自定義靶點、校準線繪制及多批次對比;

→ DIA-NN、Spectronaut等AI工具提升背景建模能力,優化信噪比;

→ 多指標數據整合:將肽段豐度、保留時間穩定性與多肽冗余信息綜合打分,提升定量置信度。


PRM定量dànbáizhì組學正在成為jīngquè醫學研究的關鍵技術之一。通過在樣本準備、肽段設計、質譜采集及數據處理等環節的系統優化,科學家正不斷拓展低豐度蛋白的檢測邊界。百泰派克生物科技致力于為科研客戶提供高靈敏、高準確、高重現性的PRM定量解決方案。無論是早期標志物驗證,還是靶向蛋白通量監測,我們都能提供從項目設計到交付的全流程一站式服務。歡迎聯系百泰派克,獲取定制化靶向dànbáizhì組學項目方案,讓jīngzhǔn定量更進一步!


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,N端測序,C端測序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。


※服務優勢:

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。


※服務優勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。



三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。


※服務優勢:

1.技術優良,*技術空白

采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大,成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

優化PRM定量蛋白質組學,實現高靈敏度低




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;

2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;

4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;

5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!



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