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引言:從表達量到功能狀態,蛋白組學的全新進階
蛋白組學聚焦于dànbáizhì的表達水平,能夠揭示不同條件下蛋白豐度的變化,但這一策略難以捕捉到dànbáizhì的“功能狀態"——即它們是否處于激活或抑制、結合或游離的生理角色中。為了解決這一盲點,化學dànbáizhì組學(Chemical Proteomics)應運而生?;瘜Wdànbáizhì組學通過引入具有靶向活性蛋白能力的化學探針(Chemical Probes),結合高分辨率質譜分析,實現對dànbáizhì功能狀態的jīngzhǔn描繪。它不僅是一種技術方法,更是連接蛋白功能、疾病機制與藥物研發的橋梁。
一、化學dànbáizhì組學的核心原理
化學dànbáizhì組學以活性蛋白的共價標記和選擇性富集為基礎,結合質譜平臺進行定量分析,從而揭示在特定生理或病理狀態下真正發揮作用的功能蛋白群體。
這一過程通常包括以下幾個關鍵步驟:
1、化學探針設計與標記:探針與活性蛋白共價結合,實現jīngzhǔn識別
2、點擊化學或親和富集:通過shēngwùsù化、熒光標記等手段提取目標蛋白
3、蛋白酶解與質譜分析:消化后上機進行高分辨率質譜檢測與定量
4、生物信息學解析:識別活性蛋白并進行功能富集、通路分析
二、化學探針:化學dànbáizhì組學的“搜索引擎"
1、化學探針的三大模塊:
(1)識別單元:結合特定酶類或功能蛋白的活性位點
(2)反應基團:與靶點殘基形成共價鍵,確保標記穩定
(3)報告標簽:如shēngwùsù、熒光團或炔基,用于后續富集與檢測
2、常見類型包括:
(1)活性位點標記探針(ABPs):適用于sīānsuān酯酶、半guāngānsuān酶等
(2)點擊化學探針(Click Probes):實現標簽的模塊化拓展
(3)光親和探針(Photoaffinity Probes):用于小分子-蛋白互作研究
三、化學dànbáizhì組學的應用前景
1、構建活性蛋白圖譜
通過特異性探針標記活性蛋白,結合質譜分析,可在細胞、組織或疾病模型中構建功能蛋白圖譜,挖掘關鍵調控節點。
2、靶點篩選與藥物機制研究
化學探針可作為競爭性配體,與候選藥物共同處理樣本,從而評估其靶點結合能力,是靶點驗證和藥物篩選的重要工具。
3、信號通路動態監控
化學dànbáizhì組學能夠實時追蹤信號分子的酶活狀態變化,有助于解析復雜信號通路中的關鍵響應元件。
百泰派克生物科技解決方案
百泰派克生物科技依托成熟的化學dànbáizhì組學平臺,提供從探針定制合成到高分辨質譜檢測再到zhuānyè生信解讀的一站式服務:
多類化學探針定制服務(ABP、Click、光親和)
高通量樣本處理流程,適配組織、細胞、體液等多種樣本類型
支持TMT、SILAC、Label-Free等定量策略
提供活性蛋白圖譜構建、差異分析與通路富集結果
化學dànbáizhì組學代表了dànbáizhì組研究的新高度,它不僅僅關心“有哪些蛋白",更關心“哪些蛋白正在發揮作用"。借助化學探針和質譜技術,這一領域正迅速成為功能生物學與jīngzhǔn醫療的關鍵橋梁。如果您正在尋找有關蛋白功能狀態、靶點驗證或機制解析的解決方案,歡迎聯系百泰派克生物科技,我們將以zhuānyè的技術平臺與服務,助力您的科研突破。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
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百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
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1.技術先進,填補技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
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