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如何通過樣品標識系統實現電泳實驗的樣品追溯?

2025-5-21  閱讀(51)

分享:
在電泳實驗中,樣品標識系統是實現樣品追溯的基礎,其核心是通過、清晰、穩定的標識將樣品與實驗全流程信息綁定。以下是具體實現方法和操作要點:

一、構建樣品標識系統的基本原則

  1. 維一性
    每個樣品對應一個重復的標識符,避免因重名或編號沖突導致混淆(如不同批次樣品編號需包含時間維度)。

  2. 可讀性與穩定性
    標識需在實驗各環節(如高溫、液體接觸環境)中保持清晰,可通過物理標簽(如防水貼紙)或電子標簽(如條形碼、二維碼)實現。

  3. 信息承載性
    標識需隱含樣品的關鍵屬性(如來源、類型、處理狀態),無需額外查詢即可快速識別樣品基本信息。

  4. 可擴展性
    預留編號擴展空間(如增加子編號),適應多組學實驗(如同時進行 DNA 和蛋白質電泳)或大規模樣本的追溯需求。

二、樣品標識系統的核心要素與實現方式

1. 標識符的設計規則

(1)編號結構設計
采用 “前綴 + 時間 + 流水號 + 子標識" 組合模式,示例如下:


  • 前綴:區分樣品類型或實驗用途

    • DNA 電泳樣品:D-

    • 蛋白質電泳樣品:P-

    • 臨床樣本:C-

  • 時間:體現采集或實驗日期,格式為 YYYYMMDD(如 2025 年 5 月 21 日:250521)

  • 流水號:當日樣品的順序編號(如 001、002…)

  • 子標識(可選):標注處理狀態或分組信息

    • 未經處理:U

    • 已純化:P

    • 實驗組:A-1、對照組:B-1


示例編號


  • 2025 年 5 月 21 日第 3 個臨床蛋白質電泳樣本(已純化,實驗組):C-P-250521-003-A-1-P

  • 解讀:臨床樣本(C)- 蛋白質(P)- 日期 250521 - 流水號 003 - 實驗組 A-1 - 已純化(P)

(2)特殊場景標識
  • 混合樣品:在編號后加 “Mix"(如 D-250521-004-Mix,表示混合 DNA 樣品)。

  • 重復實驗樣品:在原編號后加后綴(如 P-250521-001-R1,R1 表示第一次重復)。

2. 標識載體的選擇與應用

載體類型適用場景操作要點優勢
防水標簽紙樣品管(EP 管、離心管)、上樣梳、電泳槽分區- 用油性記號筆手寫編號或激光打印
- 貼于管身中上部,避免遮擋刻度
成本低,適合小規模實驗
條形碼 / 二維碼大規模樣本、自動化數據錄入場景(如 LIMS 系統)- 使用專業標簽打印機生成
- 編碼內容包含樣品全信息(可掃碼讀取詳細檔案)
高效防錯,支持電子數據快速關聯
熒光標記筆凝膠板、電泳槽可視化標識- 用耐有機溶劑的熒光筆在凝膠邊緣標記編號
- 拍照時可通過熒光識別
直接與電泳結果影像綁定,直觀性強
電子標簽(RFID)高自動化實驗室,需實時追蹤樣品位置- 在樣品管中嵌入微型 RFID 芯片
- 通過讀卡器自動記錄樣品所在儀器 / 位置
全流程自動化追蹤,減少人為誤差

3. 標識與實驗環節的綁定

  • 樣品采集階段
    采集時立即標記樣品管,同步填寫《樣品登記表》,記錄編號與來源信息(如患者姓名、組織部位)。

  • 處理階段
    每一步處理(如核酸提取、蛋白定量)后,核對標識是否完整,若標簽脫落需按原編號補打新標簽。

  • 上樣階段

    • 在電泳槽對應泳道位置貼標簽(如 “泳道 3:D-250521-001"),或用熒光筆在凝膠邊緣標記編號。

    • 拍照記錄上樣前的凝膠布局,保留原始影像作為追溯依據。

  • 結果分析階段
    在凝膠照片、電泳圖譜上標注樣品編號,通過編號關聯至原始處理記錄和儀器參數(如電泳儀型號、電壓設置)。

三、樣品標識系統與追溯流程的協同

1. 建立標識 - 信息關聯檔案

使用電子表格或實驗室信息管理系統(LIMS)建立《樣品追溯檔案》,示例如下:


樣品編號來源類型處理步驟上樣信息結果文件路徑操作人員
D-250521-001患者 A-12DNA提取(試劑盒批號 K250401)→純化泳道 1,10 μL\ 凝膠照片 \D-250521-001.tifXXX
P-250521-002-Mix細胞株 X 裂解液蛋白質定量(濃度 800 ng/μL)泳道 5,5 μL\ 電泳圖譜 \P-250521-002.xlsxYYY

2. 異常情況處理機制

  • 標簽模糊 / 脫落:立即核對原始記錄補打標簽,并在檔案中注明 “標簽補打時間:2025-05-21 14:30"。

  • 編號重復:若發現編號沖突,以最早記錄的樣品為準,沖突樣品重新編號并標注 “原編號 XXX,因重復更改為 XXX"。

  • 跨環節追溯需求:當結果異常時,通過編號快速調取《樣品登記表》《儀器使用記錄》《試劑批次表》,排查污染或操作誤差來源。

四、常見問題與解決方案

問題原因解決方案
標識在電泳過程中脫落標簽耐水性不足或粘貼位置錯誤改用防水標簽,貼于非液體接觸區域(如試管蓋側面)
編號規則復雜難記憶結構設計冗余或邏輯不清晰簡化編號結構,使用字母縮寫代替全稱(如 “C" 代表臨床樣本),提供編號解讀手冊
多組學實驗標識混淆不同類型樣品共用編號體系為 DNA、RNA、蛋白質等設置獨立前綴(D-/R-/P-),避免跨類型編號沖突
電子數據與物理樣品脫節標識未關聯至電子檔案掃碼錄入或手動輸入編號時,強制校驗編號有效性,確保每條電子記錄對應惟一樣品

五、工具與技術輔助

  1. 實驗室信息管理系統(LIMS)
    通過 LIMS 掃描條形碼自動生成樣品檔案,實時關聯電泳儀器數據(如運行時間、電壓)和結果文件,實現 “標識 - 數據 - 流程" 一體化追溯。

  2. 圖像識別軟件
    利用 ImageJ 等工具對凝膠照片中的熒光標識進行自動識別,匹配至樣品編號,減少人工比對誤差。

  3. 區塊鏈技術(可選)
    對關鍵標識信息(如編號、操作人員、時間戳)進行區塊鏈存證,確保追溯數據不可篡改,適用于高合規性需求場景(如司法鑒定)。

總結

通過科學的編號規則可靠的標識載體全流程信息關聯,樣品標識系統可將電泳實驗中的物理樣品轉化為可追溯的 “數字檔案"。其核心在于從源頭綁定單獨標識,并通過標準化記錄確保每個環節可溯源,最終實現實驗誤差可定位、結果可復現、責任可界定,為科研和生產提供嚴謹的數據支撐


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