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多通道流動注射分析儀主要用于測定土壤銨態氮、硝態氮、亞硝態氮等；在水質分析中主要應用于測定水質的銨態氮、硝態氮、亞硝態氮、總氮、磷酸鹽、總磷、碳酸鹽、碳酸氫鹽、氯化物、硫酸鹽、高錳酸鹽指數、總化物、總揮發酚、表面活性劑、硫化物、硅酸鹽和硼酸鹽等。
維護：
1、自動進樣器主要有A、B、C三個微電機，A控制水平縱向，B控制水平橫向，C控制垂直方向。A、B電機均有一條水平傳動軸，其起止動作由一個簡單的光電控制裝置控制，要注意保護好那個黑色絕緣膠片；C電機的控制原理類似于自行車的車閘裝置，要注意不能在傳動線附件放置任何東西，以免妨礙傳動線的動作甚至損壞傳動線。
2、由于A、B電機的傳動軸是水平的，容易積累磨損的顆粒和塵灰，從而導致進樣不到位的問題。可通過分別向后、向左翻轉90度，滴加數滴酒精、上下輕輕拉動微電機的辦法，清洗A、B電機傳動軸上積累的微小顆粒。滴加時，注意酒精不能掉進自動進樣器的集成線路板上，否則有可能導致線路短線。特別要提醒的是，不能使用潤滑油、凡士林之類的潤滑用品，否則微小顆粒不單清洗不干凈，反而可能會越積越多，嚴重時可使傳動軸和微電機報毀。
3、C電機的傳動線長時間使用后可能會變長，這時可以作適用調整。調整的標準是，使進樣針的最下部稍稍突出定位環。如果進樣針固定得太高，一是進樣時容易因為針的晃動而使針頂在定位環上，二是進樣時有可能因為插得不夠深造成吸空(尤其是一杯樣品需要多次進樣時)；如果進樣針固定得太低，進樣時容易因為插得太深頂在樣品杯底部造成進樣不暢。
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