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如何操作賽默飛熒光定量PCR儀

2025-3-24  閱讀(243)

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操作賽默飛熒光定量PCR儀需要按照一系列步驟來配置設備、設置實驗程序、運行實驗和分析數據。以下是詳細的操作步驟和注意事項,幫助您順利完成實驗。

一、準備工作

在正式操作賽默飛熒光定量PCR儀前,請確保以下準備工作已完成:

  1. 檢查儀器狀態

    • 確保儀器已連接電源并啟動。

    • 檢查熱蓋和樣品架,確保它們安裝牢固并處于正常工作狀態。

  2. 檢查反應體系

    • 準備好PCR反應體系,包括模板、引物、酶、熒光染料等。

    • 準備好所需的樣品(如DNA、RNA模板),并檢查其濃度。

  3. 確保計算機和儀器連接正常

    • 確保儀器與控制計算機或觸摸屏之間的連接正常,可以順利打開實驗軟件。

二、創建實驗程序

  1. 打開儀器

    • 按下設備的開機按鈕,啟動儀器。儀器啟動后,屏幕會顯示歡迎界面。

    • 如果儀器已配備觸摸屏界面,直接通過觸摸屏操作。

  2. 進入實驗設置界面

    • 在儀器軟件的主界面上,選擇“新建實驗"或“新建程序"選項,以創建新的實驗程序。

  3. 輸入實驗信息

    • 在創建新實驗時,首先需要輸入實驗名稱、實驗描述、樣本信息(如目標基因、引物等)等相關信息。

    • 選擇PCR類型:通常選擇“熒光定量PCR"。

    • 選擇引物類型:如果使用SYBR Green、TaqMan或其他探針,進行相應選擇。

  4. 設置反應體系

    • 反應體積:根據實驗需求設置反應體積(常見體積有20 μL、25 μL、50 μL等)。

    • 樣品信息:輸入樣品類型和濃度信息。確保樣品濃度與反應體系相匹配。

    • 引物/探針選擇:輸入或選擇所使用的引物和探針信息。確保熒光探針的選擇正確,并且與所用的熒光染料兼容。

三、設置熱循環條件

  1. 設置溫度和時間

    • 變性溫度:通常設置在94-98°C之間。

    • 退火溫度:根據引物的Tm值,通常設置在50-65°C之間。

    • 擴增溫度:一般設置為72°C(適用于大多數DNA聚合酶)。

    • 延伸時間:根據PCR產物的長度設定,通常設置為每千堿基15秒。

  2. 設置循環次數

    • 設置PCR循環次數,通常為40次,但根據樣品特性可以適當調整。

  3. 熔解曲線分析(可選):

    • 如果需要進行特異性檢測,可以在最后一步啟用熔解曲線分析。熔解曲線可以幫助檢測PCR產物的特異性,避免非特異性擴增。

四、選擇熒光檢測通道

  1. 選擇適當的熒光染料

    • 如果使用單一染料(如SYBR Green),選擇對應的檢測通道。

    • 如果使用多種熒光染料(如TaqMan探針),選擇多個通道進行多重檢測。

  2. 設置熒光信號采集時間點

    • 在每個擴增周期的合適位置采集熒光信號。通常選擇在擴增的末期進行熒光信號采集。

五、啟動實驗

  1. 檢查所有設置

    • 在開始實驗之前,確保所有設置無誤,檢查反應體系、溫度條件、循環次數和熒光探針設置等。

    • 如果一切正常,點擊“開始實驗"按鈕啟動PCR反應。

  2. 儀器運行

    • 儀器會自動完成熱循環過程,同時通過熒光檢測系統監測反應中的熒光信號變化。

    • 實驗過程可以實時查看圖表、溫度、熒光信號等數據。

六、數據分析

  1. 實驗完成后查看數據

    • 實驗結束后,儀器會生成實時定量PCR結果,包括Ct值、熒光信號變化曲線等。

    • 點擊“數據分析"進入數據分析界面,可以選擇查看熒光信號曲線、標準曲線、Ct值等。

  2. 數據分析選項

    • Ct值分析:根據熒光信號的變化,自動計算各樣本的Ct值,并進行基因定量。

    • 標準曲線分析:如果需要定量分析樣本的濃度,可以通過標準曲線法進行分析。

    • 熔解曲線分析:對PCR產物進行熔解曲線分析,檢查擴增產物的特異性。

  3. 導出數據

    • 在數據分析完成后,用戶可以將分析結果導出為Excel、PDF等格式,便于進一步分析或報告書寫。

七、實驗結束后的注意事項

  1. 清潔儀器

    • 每次實驗結束后,清理PCR儀的樣品架和反應管,防止樣品污染。

    • 定期清潔儀器表面和熱蓋,避免熒光信號的干擾。

  2. 保存實驗數據

    • 確保保存實驗數據和程序設置,避免數據丟失。可以將數據保存在云端或外部存儲設備上。

  3. 檢查儀器運行狀態

    • 定期檢查儀器的運行狀況,包括校準、溫控系統、熒光檢測系統等,確保儀器處于最佳工作狀態。

八、常見問題及解決方法

  1. 信號過低或過高

    • 可能原因:模板濃度不適、引物濃度不合適、反應體系配制不當。

    • 解決方法:適當調整模板濃度和引物濃度,確保反應體系的準確性。

  2. 非特異性擴增

    • 可能原因:引物設計問題、退火溫度設置不當。

    • 解決方法:優化引物設計、調整退火溫度,確保擴增特異性。

  3. 實驗反應失敗

    • 可能原因:反應體系準備不充分或試劑過期。

    • 解決方法:檢查試劑是否過期,確保所有試劑的新鮮度并準確配制反應體系。

總結

操作賽默飛熒光定量PCR儀需要按步驟配置實驗程序、設置反應體系、選擇合適的熱循環條件和熒光探針通道。儀器的智能化設計使得操作相對簡便,但仍然需要細致地檢查設置和反應體系,確保實驗的順利進行。通過合理設置和分析,您可以得到高質量的定量PCR結果。


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