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賽默飛熒光定量PCR儀的工作原理

2024-11-29  閱讀(507)

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賽默飛熒光定量PCR儀的工作原理

賽默飛熒光定量PCR儀(Thermo Fisher Scientific Real-Time PCR Systems)是基于聚合酶鏈式反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction, PCR)技術(shù)的熒光定量檢測設(shè)備,其核心原理是通過實時監(jiān)測熒光信號的變化來定量分析核酸擴增過程,揭示目標DNA或RNA的起始量。以下是賽默飛熒光定量PCR儀的詳細工作原理:


1. 基本工作流程

賽默飛熒光定量PCR儀的工作流程可以分為以下幾個階段:

(1) 樣本準備

  • 提取核酸:目標DNA或RNA從細胞、組織或其他樣本中提取。

  • 反轉(zhuǎn)錄(對于RNA樣本):使用逆轉(zhuǎn)錄酶將RNA轉(zhuǎn)錄為cDNA。

(2) PCR反應(yīng)設(shè)置

  • 反應(yīng)體系:PCR混合液包括模板核酸、引物、探針或熒光染料、dNTP、Taq DNA聚合酶及緩沖液。

  • PCR試劑

    • 使用特定熒光標記的探針(如TaqMan探針)或熒光染料(如SYBR Green)以實時監(jiān)測擴增反應(yīng)。

(3) PCR循環(huán)

PCR反應(yīng)在熱循環(huán)系統(tǒng)中分為以下三個步驟,循環(huán)30-40次:

  1. 變性:高溫(通常為95℃)使雙鏈DNA分離為單鏈。

  2. 退火:降低溫度(通常為55-65℃),引物與模板DNA結(jié)合。

  3. 延伸:通過Taq DNA聚合酶在72℃合成新鏈。

(4) 熒光信號檢測

  • 賽默飛熒光定量PCR儀內(nèi)置的光學檢測系統(tǒng)實時監(jiān)測每個PCR循環(huán)中的熒光信號變化。

  • 熒光強度與目標核酸的擴增量成正比。


2. 熒光定量PCR的關(guān)鍵技術(shù)

(1) 熒光信號產(chǎn)生與檢測

賽默飛熒光定量PCR儀使用熒光探針或染料標記擴增反應(yīng)的產(chǎn)物,具體技術(shù)包括:

  1. TaqMan探針法

  • 探針是一段帶有熒光標記和猝滅基團的寡核苷酸。

  • 工作原理:

    • 在PCR延伸階段,Taq DNA聚合酶的5'-3'外切酶活性將探針降解,釋放熒光基團,使熒光信號得以監(jiān)測。

    • 熒光強度與擴增產(chǎn)物數(shù)量呈線性相關(guān)。

  1. SYBR Green染料法

  • SYBR Green是一種嵌入雙鏈DNA的熒光染料。

  • 工作原理:

    • 隨著PCR反應(yīng)中雙鏈DNA的生成,SYBR Green嵌入其中,產(chǎn)生熒光信號。

    • 熒光強度的增加反映擴增產(chǎn)物的累積量。

  1. 高分辨率熔解曲線分析(HRM)

  • HRM技術(shù)通過監(jiān)測DNA解鏈時的熒光信號變化,用于檢測單核苷酸多態(tài)性(SNP)和突變分析。

(2) 定量方法

賽默飛熒光定量PCR儀通過以下兩種方式實現(xiàn)核酸的絕對定量或相對定量分析:

  1. 絕對定量

    • 使用標準曲線,通過已知濃度標準品的熒光信號,計算未知樣本中核酸的起始量。

  2. 相對定量

    • 通過參考基因的表達量對目標基因進行標準化分析,適合基因表達研究。

(3) 光學檢測系統(tǒng)

  • 賽默飛熒光定量PCR儀配備多色光學檢測系統(tǒng):

    • 使用LED光源激發(fā)熒光。

    • CCD相機或光電二極管陣列捕獲熒光信號。

    • 系統(tǒng)實時采集熒光信號并進行數(shù)據(jù)分析。


3. 數(shù)據(jù)分析與結(jié)果輸出

賽默飛熒光定量PCR儀通過內(nèi)置的軟件平臺對熒光信號進行分析,主要步驟包括:

(1) 閾值循環(huán)數(shù)(Ct值)

  • Ct值是熒光信號達到設(shè)定閾值時的PCR循環(huán)數(shù)。

  • Ct值越低,模板起始量越高。

(2) 標準曲線分析

  • 通過繪制標準曲線,計算未知樣本的絕對濃度。

(3) 熔解曲線

  • 熔解曲線用于驗證PCR擴增的特異性,單一峰值表明反應(yīng)特異性好,多峰值可能提示非特異擴增或引物二聚體。

(4) 定量結(jié)果展示

  • 數(shù)據(jù)可通過曲線圖、柱狀圖等形式直觀展示,便于分析。


4. 賽默飛熒光定量PCR儀的優(yōu)化設(shè)計

  1. 高靈敏光學檢測

    • 多通道熒光檢測系統(tǒng)可同時監(jiān)測多個靶標,確保實驗靈活性和高效性。

  2. 快速熱循環(huán)系統(tǒng)

    • 賽默飛儀器通過精準的溫度控制系統(tǒng),加速PCR反應(yīng),縮短實驗時間。

  3. 智能化軟件平臺

    • 支持自動分析Ct值、熔解曲線,簡化數(shù)據(jù)處理流程。

    • 云端連接功能,支持遠程實驗管理和數(shù)據(jù)共享。

  4. 兼容性與靈活性

    • 支持96孔、384孔板和TaqMan Array卡等多種平臺。

    • 靈活適配不同熒光染料和探針。


5. 賽默飛熒光定量PCR儀的優(yōu)勢

  • 靈敏度高:精確檢測低豐度模板。

  • 多通道檢測:最多支持8色熒光檢測,適合多重實驗。

  • 實驗效率高:快速模式大幅縮短反應(yīng)時間。

  • 特異性強:采用TaqMan探針,避免非特異性擴增影響結(jié)果。

  • 便捷操作:直觀界面設(shè)計,支持自動化運行。


6. 應(yīng)用領(lǐng)域

  1. 基因表達分析

    • 精確定量基因表達變化,用于研究基因調(diào)控機制。

  2. 病原體檢測

    • 快速、準確檢測病毒和細菌,核酸檢測。

  3. 遺傳突變分析

    • 檢測SNP和點突變,適合癌癥研究和遺傳性疾病篩查。

  4. 藥物篩選

    • 高通量基因表達分析,為新藥開發(fā)提供支持。

  5. 分子診斷

    • 應(yīng)用于個性化醫(yī)療,通過實時檢測提供臨床診斷依據(jù)。


總結(jié)

賽默飛熒光定量PCR儀通過先進的光學檢測系統(tǒng)、靈敏的熒光探針技術(shù)和高效的反應(yīng)體系,確保實驗數(shù)據(jù)的精確性與可靠性。其工作原理結(jié)合TaqMan探針法和SYBR Green染料法,支持多種定量檢測需求。同時,智能化操作和多樣化適配平臺使其廣泛應(yīng)用于科研和臨床領(lǐng)域,為分子生物學研究提供強有力的技術(shù)支持。



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