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肽質量指紋圖譜(PMF)是基于質譜技術的蛋白質鑒定方法。質譜技術通過測量肽段的質量來識別和分析蛋白質。在生物醫學研究中,PMF的應用尤為廣泛且深入。特別是在癌癥研究中,PMF技術被用來識別和定量分析癌癥組織和正常組織中的蛋白質差異,從中篩選出潛在的癌癥標志物。這些標志物的發現對于癌癥的早期診斷和個性化治療方案的制定具有重要意義。此外,通過對癌癥相關蛋白質進行深入研究,肽質量指紋圖譜(PMF)還能幫助揭示癌癥發生和發展的分子機制。在藥物研發過程中,研究人員可以利用PMF技術篩選和驗證藥物靶點,從而提高藥物的特異性和療效。通過分析藥物與靶標蛋白的相互作用,PMF可以幫助優化藥物的設計和開發流程。肽質量指紋圖譜(PMF)的應用已經擴展到環境科學和農業中。在環境科學中,PMF通過對環境樣品中的蛋白質進行分析,使研究者能夠評估生態系統的健康狀況,追蹤污染物的來源,并對環境污染進行及時監測。在農業領域,PMF被用于研究作物的蛋白質組,以此來指導育種方案的優化,提高作物的產量和抗病性。通過對農作物蛋白質的深入解析,肽質量指紋圖譜(PMF)為農業生產提供了科學依據,推動了農業的可持續發展。
一、肽質量指紋圖譜(PMF)的技術流程
1、樣品制備
樣品制備是肽質量指紋圖譜(PMF)的首要步驟。樣品中的蛋白質需要經過提取和純化。通常使用緩沖液、變性劑和還原劑等化學試劑,以確保蛋白質充分溶解并適于后續酶切步驟。再使用特定的酶(如yídànbáiméi)對蛋白質進行酶切反應,產生一系列肽段。
2、質譜分析
在質譜分析階段,利用質譜儀對酶切產生的肽段進行檢測。質譜儀通過離子化技術,將肽段轉化為帶電離子,并測量這些離子的質荷比(m/z)。獲得的質譜數據為肽質量指紋圖譜的核心。通過與數據庫中的理論質譜圖進行比對,可以識別出樣品中的蛋白質。
3、數據分析
通過計算機軟件對質譜數據進行處理,將實驗所得的肽質量與數據庫中的理論肽質量進行匹配。匹配結果用于推斷樣品中蛋白質的種類和數量。
二、肽質量指紋圖譜(PMF)的優勢與挑戰
1、優勢
(1)PMF具有高通量和高靈敏度的特點,能夠快速處理大量樣品,適用于大規模蛋白質組學研究。
(2)與其他蛋白質鑒定方法相比,肽質量指紋圖譜(PMF)所需樣品量較少,能夠在樣品有限的條件下實現有效分析。
(3)PMF技術的自動化程度較高,減少了人為誤差,提高了實驗的可重復性和可靠性。
2、挑戰
(1)復雜樣品中的蛋白質混雜和修飾可能導致質譜信號的重疊和干擾,影響結果的準確性。
(2)對于質譜數據的分析,仍需不斷優化算法和數據庫,以提高鑒定的準確性和效率。
(3)在某些情況下,肽質量指紋圖譜(PMF)可能難以區分同源蛋白質或具有相似肽質量的蛋白質。
百泰派克生物科技的團隊由經驗豐富的科學家和技術人員組成,能夠為您量身定制實驗方案,確保得到zuì準確的結果。我們的服務不僅涵蓋蛋白質鑒定,還包括復雜樣品分析和數據解析,幫助客戶在復雜生物系統中快速獲取有價值的信息。與我們合作,您將體驗到高效、jīngzhǔn、可靠的服務,為您的研究和產品開發提供堅實的支持。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對蛋白質序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對蛋白質的氨基酸組成分析,N端測序,C端測序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白質N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質,提供基于從頭測序法的蛋白質從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
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1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
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4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白質組學、靶向蛋白質組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
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5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
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采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
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②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
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百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從蛋白質、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
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