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異硫氰酸胍/氯化銫超速離心法制備 RNA 實驗

閱讀:714      發布時間:2023-07-07
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材料與儀器

1. 細胞和組織
細胞/組織,凍于液氮

2. 緩沖液、溶液和試劑
氯仿
氯化銫溶液,5.7mol/L(5.7mol/L 氯化銫,25 mmol/L 醋酸鈉,pH6.0,1mmol/LEDTA,pH8.0)
用焦碳酸二乙酯(DEPC) 處理過的水
二硫蘇糖醇(DTT)0.2 mmol/L
EDTA,1mmol/L,pH8.0
乙醇,70%(體積分數)
異硫氰酸胍裂解緩沖液 (4mol/L 異硫氰酸胍,25 mmol/L 醋酸鈉,pH6.0,1mmol/LEDTA,pH8.0)
異丙醇
N-月桂酰肌氨酸,20%200 g/L)
氯化鋰(LiCl),8mol/L
液氮
β-巰基乙醇,10 ml/L
苯酚, 水飽和,pH4.0
3. 離心機和轉子
BeckmanTi50 轉子或相當的轉子
4. 特殊設備
研缽和杵,用 DEPC 處理過的水洗滌,預冷
超速離心管(異質同晶共聚材料),或相當的 Polygon, 或相當的高速勻漿器

步驟

1、使用研缽和杵在液氮下將樣品研磨成細粉。使用 Polygon 均化器或其他合適的器具在 7 ml 胍裂解緩沖液中均質化組織或細胞(達 1X109 個)。
2、將 4 ml5.7mol/L CsCl 溶液加到超速離心管中。
3、將 1ml5.7mol/L CsCl 溶液、120ul10mol/L 的沒-巰基乙醇和 240ulN-月桂酰肌氨酸加到裂解產物中。
4、將氯化銫/裂解產物混合物混合,小心使之位于離心管中的氯化銫溶液上分層。
5、20°C 180000 g 離心 21 h。
6、移棄氯化銫上清液,小心避免擾動管底的 RNA 沉降物。
7、小心將 RNA 沉降物再溶解于 750ul 異硫氰酸胍裂解緩沖液中。
8、加等體積酚,混勻。
910000g 離心 15 min
10、將水相轉移到一新管中。重復水相的酚抽提,直到界面變清。
11、向清澈的水相加 1 倍體積氯仿。
12、混合,10000 g 離心 l0 min。
13、將水相轉移到一干凈試管中。加等體積的異丙酵和 1/10 體積 8mol/L 的氯化鋰。10000g 離心10min
14、移棄上清液。用 750ul70% 乙醇洗滌 RNA 沉降物,10000 g 離心。
15、移棄乙酵,風干沉降物,再溶解于 50~500ul0.2 mmol/L DTT 中。
16RNA 儲存于-70°C。


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