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現代液相色譜中，分離效果好壞很大程度上取決于色譜填料的選擇中。但是色譜填料的選擇范圍很寬，要做合適的選擇，必須對此有一定的認識和了解。
一、硅膠基質填料
1、正相色譜
正相色譜用的固定相通常為硅膠（Silica），以及其他具有極性官能團，如胺基團（ZH2,APS）和氰基團（CN，CPS）的鍵合相填料。
由于硅膠表面的硅羥基（SiOH）或其他團的極性教強，因此，分離的次序是依據樣品中的各組份的極性大小，即極性強落的組份zui先被沖洗出色譜柱。
正相色譜使用的流動相極性相對比固定相低，如：正乙烷（Hexane）,氯（Chloroform） 二氯甲烷（Methylence Chloride）等.
2、反相色譜
反相色譜填料常是以硅膠為基礎，表面鍵合有極性相對教弱的官能團的鍵合相。
反相色譜所使用的流動相極性教強，通常為水，緩沖液與甲醇，已腈等混合物。
樣品流出色譜柱的順序是極性教強組合zui先被沖出，而極性弱的組份會在色譜柱上有更強的保留。
常用的反相填料有C18（ODS） C8（MOS）。C4（B）C6H5（Phenyl）等。
二、聚合物填料
聚合物調料多為聚苯乙烯-二乙烯基苯或聚甲基丙酸至等，其主要優點是在PG值為1-14均可使用。
相對與硅膠基質的C18填料，這類填料具有更強的淑水性；大孔的聚合物填料對蛋白質等樣品的分離非常有效。
現在的聚合物填料的缺點是相對硅膠基質填料，色譜柱柱效教低。
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