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所謂醫藥中間體，實際上是一些用于藥品合成工藝過程中的一些化工原料或化工產品。這種化工產品，不需要經過藥品的生產許可證，即可在普通的化工廠生產，當達到一些級別的時候，便可用于藥品的合成。

對醫藥中間體成分分析及結構鑒定技術探究主要是運用柱篩選技術開發含量和有關物質檢測，用柱篩選技術開發手性雜質檢測，氣相色譜技術進行殘留溶劑檢測，技術進行定量分析及鑒別試驗，卡爾費休法進行水分含量測試，色譜與質譜聯用進行微量雜質，離子色譜法進行離子測試，ICP、原子吸收、ICP-MS進行金屬含量檢測等方法，來確認醫藥中間體的結構和純度。

三重四極桿質譜的優勢

目前做醫藥中間體合成方面的用戶一個比較大的痛點在于不確定化合物的結構，使用單四級桿質譜容易被被干擾，得到的碎片也較少，主要是靠源內裂解產生，定性信息不如三重四級桿質譜；三重四級桿質譜針對母離子的子離子進行掃描，能產生更多的碎片信息，因此用戶通過二級譜圖可以得到更多的信息，可以有效解決不確定化合物結構的痛點，同時三重四級桿質譜可以用于反向助力合成路徑的優化，給合成方法的開發可能會提供更多的想法。