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醫療機構的隨時消毒和終末消毒由醫療機構安排專人進行，疾病預防控制機構做好技術指導。非人員開展消毒工作前應接受當地疾病預防控制機構培訓，采取正確的消毒方法并做好個人防護。必要時應及時對物體表面、空氣和手等消毒效果進行評價，由具備檢驗檢測資質的實驗室相關人員進行。

1、物體表面

按GB15982-2012《醫院消毒衛生標準》附錄A進行消毒前后物體表面的采樣，消毒后采樣液為相應中和劑。

消毒效果評價一般以自然菌為指標，必要時，也可根據實際情況，用指示菌評價消毒效果，該指示菌抵抗力應等于或大于現有病原體的抵抗力。以自然菌為指標時，消毒后消毒對象上自然菌的殺滅率>90%，可判為消毒合格；以指示菌為指標時消毒后指示菌殺滅率>99.9%，可判為消毒合格。

2、室內空氣

按GB15982-2012《醫院消毒衛生標準》附錄A進行消毒前后空氣采樣，消毒后采樣平板中含相應中和劑。消毒后空氣中自然菌的消亡率>90%，可判為消毒合格。

3、工作人員手

按GB15982-2012《醫院消毒衛生標準》附錄A進行消毒前后手的采樣，消毒后采樣液為相應中和劑。消毒前后手上自然菌的殺滅率=90%，可判為消毒合格。

4、醫院污水消毒效果

按GB18466《醫療機構水污染物排放標準》相關規定進行評價。湖北省武漢市等出現社區持續傳播地區，可以針對集中收治點和集中隔離點等臨時特殊場所制定當地的衛生防護方案。