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熒光染料是指吸收一定波長的光波并發射出比所吸收的光波長更大的另一種光波的物質。它們大多是含有苯環或具有共軛雙鍵的雜環的化合物。熒光染料可以單獨使用，也可以組合成復合熒光染料。

熒光標記是將熒光染料（熒光團或熒光素）選擇性共價結合或物理吸附在待研究分子（蛋白質、多肽等）的某一基團上的方法。利用其熒光特性提供有關所研究物體的信息。

研究應用：

熒光染料由于靈敏度高、操作方便，已逐漸取代放射性同位素作為檢測標記物，廣泛應用于熒光免疫學、熒光探針、細胞染色等領域。包括特異性DNA染色，用于染色體分析、細胞周期、細胞凋亡等相關研究。許多其他核酸染料是多色染色系統中有用的復染劑，可作為背景對照，標記細胞核，使細胞內結構的空間關系一目了然。

免疫分析

熒光標記單克隆抗體技術為流式細胞術在細胞膜及細胞內各種功能抗原、腫瘤基因蛋白等領域的研究拓展了無限的應用空間。熒光探針可以通過蛋白質交聯劑與單克隆抗體共價結合。免疫熒光標記常用的染料是異硫氰酸熒光素 (FITC)、藻紅蛋白 (PE) 和 AlexaFluor 系列染料。

核酸擴增檢測

核酸熒光染料對細胞核進行染色，定量測定細胞發出的熒光強度，從而可以測定細胞核中DNA和RNA的含量，分析細胞周期和細胞增殖情況。有多種熒光染料可以對細胞中的 DNA 或 RNA 進行染色。常用的DNA染料有碘化丙啶（PI）、DAPI、Hoechst 33342等，RNA染料有噻唑橙、吖啶橙等。

染料介紹：

APDye Fluor 647（Alexa Fluor 647 等效物；AF647）是一種明亮的綠色熒光染料，適合與 633、650 nm 氬激光配合使用。該染料是水溶性的，并且在 pH 4 至 pH 10 范圍內對 pH 值不敏感。該染料具有 4 個磺酸鹽基團，使其水溶性高，在水溶液中聚集較少。 APDye Fluor 647 用于蛋白質和抗體標記，或高標記密度的核酸應用。您可能對Alexa 647 nhs 酯感興趣，點擊了解更多信息。

APDye Fluor 647 在結構上與 Alexa Fluor 647 相似，并且光譜與 Cy5 Dye、Alexa Fluor 647、CF 647 Dye 或任何其他基于 Cyanine5 的熒光染料幾乎相同。