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Cy5 (Cyanine 5) 是一種發遠紅(far-red)熒光的花青素熒光染料。它的消光系數很高，熒光很亮，并且對pH不敏感，一般可以用633 nm或647 nm的激光束激發然后用 Cy5或APC濾片觀察，所以在絕大部分熒光儀器上都可以使用。Cy5熒光落在遠紅光區，使用Cy5或者其它遠紅光染料的一個重要優勢是在這個長波長光譜范圍內樣品背景熒光較低，而在這個區域CCD相機/檢測器檢測靈敏度。Cy5可以用來標記蛋白，抗體，多肽，核酸分子，納米粒等。

馬來酰亞胺(maleimide)是生物標記反應中常用的基團，它可以和巰基(-SH)通過親和加成反應生成穩定的巰醚(thioester)結構從而實現標記。盡管胺基(比如賴氨酸精氨酸側鏈)也有親和性，但在中性或微酸性緩沖液中，馬來酰亞胺選擇性標記巰基(反應速度比胺基快>1000倍)。標記反應反應迅速，選擇性高，產率好，另外，巰基是一種在生物分子中***存在的官能團，比如蛋白中的半胱氨酸(cysteine)和雙硫鍵等，因此馬來酰亞胺/巰基(maleimide/thiol)標記已成為僅次于NHS/胺基標記的***常用生物連接反應(bioconjugation)。

Cy5-馬來酰亞胺的水溶性較低，所以在水相的標記反應體系內需要使用有機共溶劑，常用有機溶劑包括DMF，DMSO和乙腈等。如需標記的分子對有機溶劑敏感，可選擇磺化花青素（sulfonated cyanine），即磺化Cy5-馬來酰亞胺。兩者的光譜性質幾乎一致，因此大部分應用可相互替換。兩者的主要區別在于：磺化染料是水溶性的，在水相的標記反應體系內不需要使用有機共溶劑，并且降低染料在水中聚集的可能性，增強標記效率。

Cy5-馬來酰亞胺標記后的產物Ex/Em是640/664nm。和它具有相似熒光特性的染料包括Alexa Fluor 647，DyLight 649，ATTO 647等。

英文名：Cyanine5 maleimide

cy5-MAL

MAL-Cy5

中文名：花青素CY5-馬來酰亞胺

CAS號：1437872-46-2（無陰離子）

分子式：C38H45N4O3

分子量：605.8

外觀：深藍色固體

純度：95%溶解性：溶于有機溶劑（DMF、DMSO、二氯甲烷），幾乎不溶于水（31μm，23 mg/L）

儲存條件：-20°C避光避濕

注意事項：

1）Cy5-馬來酰亞胺水溶性較低，標記反應可在有機溶劑中進行或者含有機助溶劑的水相中進行。

2）天然生物分子中巰基一般于氧化狀態(如雙硫鍵)存在，在馬來酰亞胺標記前，務*還原劑(如DTT，TCEP)活化巰基并除去多余還原劑。

3）馬來酰亞胺也可以和疊氮化合物反應，應避免疊氮官能團。

4）標記反應不要放在強光下，因為大部分熒光化合物在強光下長時間照射會緩慢光漂泊(photobleaching)。

相關化合物：

Cyanine5 maleimide

1437796-65-0

Sulfo-Cyanine5 maleimide

2242791-82-6

Cyanine5 amine

1807589-58-7

Cyanine5 azide (DMSO solution)

1267539-32-1

Cyanine5 carboxylic acid chloride

1032678-07-1

Cyanine5 alkyne

1223357-57-0

Cyanine5 NHS ester chloride

1032678-42-4

Cyanine5 DBCO

2182601-71-2

Cyanine5.5 maleimide

1594414-90-0

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