PMA是比較中肯的v-PCR 染料,并已在數百份同行評審的論文和大量細菌、真菌和病毒菌株中得到驗證。早期研究側重于細菌中的v-PCR,驗證了在數十種不同細菌菌株中的程序,例如大腸桿菌、李斯特菌、軍團菌、乳酸桿菌、結核分枝桿菌、衣原體、幽門螺桿菌以及許多其他與人類健康相關的菌株. v-PCR 在細菌中的應用非常廣泛,但也有許多引文在酵母和真菌、病毒以及各種其他細胞類型(如古生菌、變形蟲和寄生蟲)中使用 v-PCR。
已驗證的Viability PCR應用實例:
微生物組研究
環境測試
益生菌研究
臨床測試
食品和水衛生
葡萄酒發酵
微生物測序
V-PCR的工作原理
PMAxx 和PMA是對DNA具有高親和力的光活性染料。染料插入dsDNA并在暴露于強烈可見光時形成共價鍵。該反應通過在純化過程中去除修飾的DNA和通過DNA聚合酶抑制模板擴增的組合來抑制修飾的DNA模板的PCR擴增。由于染料是細胞膜不可滲透的,當用染料處理含有活細菌和死細菌的樣品時,只有細胞膜受損的死細菌才容易受到DNA修飾。在qPCR反應中,死細胞DNA將顯示出延遲擴增和比活細胞更高的Ct。
活性PCR染料,如PMAxx 或PMA是膜不滲透的,這使它們具有死細胞特異性。一旦進入死細胞,它們就會與DNA結合。暴露在強烈的可見光下會使染料具有活性,并使它們共價附著在DNA上,這種DNA修飾防止了隨后的PCR反應中的擴增。
v-PCR工作流程:
v-PCR的基本工作流程如下圖所示(詳細協議可在產品頁面上找到)。它適用于許多不同的樣本類型和實驗設置。對于少量培養物,樣品可以在微型離心管中制備,并在PMA-Lite 2.0 LED光解裝置中暴露在光下。
艾美捷 Viability PCR入門套件
可定制的 Viability PCR 入門套件包含使用 PMA 或 PMAxx 活力染料和 qPCR 選擇性檢測活細胞所需的材料。這些試劑盒可用于您選擇的任何細胞類型(有關已發布的經過驗證的細胞類型,請參閱PMA/PMAxx 參考列表和經過驗證的細菌菌株列表)。所有試劑盒均包含 Forget-Me-Not EvaGreenqPCR Master Mix,以及您選擇的 PMA 或 PMAxx 染料。您還可以選擇帶有或不帶有革蘭氏陰性細菌增強劑(不適用于其他細胞類型)的試劑盒。用戶將需要提供自己的引物來擴增他們感興趣的物種(請參閱此 博客文章 用于引物設計考慮)。每個試劑盒包含的試劑足以處理 80 種細菌培養物并進行200次PCR反應。
試劑盒包括:
PMA 染料或 PMAxx 染料
Forget-Me-Not EvaGreen qPCR預混液
ROX 參考染料
PMA 增強劑(僅限革蘭氏陰性菌株)
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