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    倒置顯微鏡組成和普通顯微鏡一樣，只不過物鏡與照明系統顛倒，前者在載物臺之下，后者在載物臺之上，用于觀察培養的活細胞，具有相差物鏡。倒置顯微鏡主要是利用光學平面成像的方法，和放大鏡起著同樣的作用，就是把近處的微小物體成一放大的像，以供人眼觀察。其光路長，光損較大，光路設計較復雜，對樣品高低無要求，檢測方便快速，不適合多視場分析。一般用于觀察培養皿或者培養瓶中的組織培養、細胞離體培養、浮游生物、環境保護、食品檢驗及流質沉淀物的觀察。

    而正置顯微鏡在觀察時成像為正像，這種觀察方式符合廣大用戶的觀察方式，光路設計簡單，光損少，樣品高度有要求，方便多視場觀察，鏡頭不易落灰易維護，適合觀察切片，適用于研究單位。