陰離子色譜柱是離子色譜應用較多的色譜柱，占離子色譜色譜柱的80%以上。因此，從離子色譜出現以來，絕大多數制造商均致力于陰離子分析柱的研制和發開，至今已經出現了不同系列的陰離子分析柱，其共同特點主要表現在均采用強堿性陰離子交換樹脂；固定相基質具有比較高的交聯度，有一定的機械強度；一般情況下具有pH的穩定性，特別是在堿性條件下穩定。
陰離子色譜柱由柱管、壓帽、卡套（密封環）、篩板（濾片）、接頭、螺絲等組成。柱管多用不銹鋼制成，壓力不高時，也可采用厚壁玻璃或石英管，管內壁要求有很高的光潔度。為提高柱效，減小管壁效應，不銹鋼柱內壁多經過拋光。也有人在不銹鋼柱內壁涂敷氟塑料以提高內壁的光潔度，其效果與拋光相同。還有使用熔融硅或玻璃襯里的，用于細管柱。
陰離子色譜柱如何選擇合適的清洗溶劑：
對低價親水污染物：用10倍的淋洗液；
對高價親水污染物：用1到3M的鹽酸作淋洗液；
對金屬污染物：會引起色譜峰不對稱性，如鐵離子會引起硫酸根和磷酸根的拖尾，鋁會引起磷酸根回收率降低，可采用絡合劑酸類，如0.2M草酸;
對有機污染物：有機污染物會引起色譜柱效降低，可以采用兼容的有機溶劑清洗，有時也可以采用高濃度的鹽酸與有機溶劑混合清洗則更為有效，但要注意這種溶液要混合立即使用，長時間混合會造成酸的分解并且損壞色譜柱。要特別注意色譜柱的有機兼容性，如果該色譜柱只能對15%的有機溶劑兼容，這時有機溶劑濃度就不能超過15%。
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