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一個完整的移液器移液過程需以下幾個步驟：密封性的檢查、吸液嘴的安裝、量程的調節、吸液嘴的潤洗、移液（包括吸液和排液）、卸掉吸液嘴等。具體操作如下：
1. 密合性檢查
可以用目視法檢測：將吸取液體后的移液器垂直靜置（5 ～ 10）s，觀察是否有液滴緩慢的流出。若有流出，說明有漏氣現象。
2. 吸液嘴安裝
正確的安裝方法叫旋轉安裝法。將移液器的吸液嘴連接管頂端垂直插入吸液嘴中，在輕輕用力下壓的同時，左右微微（或小幅度）轉動，但不能用力過猛，使其緊密結合，上緊即可。如果是多通道（如 8 通道或 12 通道）移液器，則可以將移液器的第一道對準第一個吸液嘴，然后傾斜地插入至全部通道與對應的吸液嘴緊密接觸，往前后方向搖動即可卡緊。
吸液嘴卡緊的標志是略微超過 O 型環，并可以看到連接部分形成清晰的密封圈。
3. 量程的調節
在調節量程時，通過旋轉按鈕將容量值迅速調整至接近被測量值；當容量值接近要測的量值后，應將移液器橫置，水平放至眼前，通過調節按鈕慢慢地將容量值調至測量值，從而避免視覺誤差所造成的影響。應當注意的是：（1）由于移液器的計數器內部有空隙產生，所以在調節被測量值時，需要先調至超過被測量的量值后再回調至被測量值，這樣可以保證最佳的準確度。（2）在調節測量值的過程中，不能將按鈕旋出最大或最小量程的位置，否則會卡住內部機械裝置而損壞移液器。
4. 吸液嘴的潤洗
吸液嘴在檢定之前，先吸取或排放蒸餾水至少1～3次，將其潤濕。這是為了讓吸液嘴內壁形成一道相同介質的液膜，確保移液器移液工作過程的準確一致性和重復性。
5. 移液（吸液與排液）
由于吸液嘴浸入液面深度不同，造成的不同液壓會影響移液器的準確度，所以依據不同的量程其吸液嘴浸入深度和停留時間也不同。
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