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1）． 過濾流動相，根據需要選擇不同的濾膜。
2）． 對抽濾后的流動相進行超聲脫氣10-20分鐘。
3）． 打開液相色譜工作站（包括計算機軟件和色譜儀），連接好流動相管道，連接檢測系統。
4）． 進入液相色譜儀控制界面主菜單，點擊manual，進入手動菜單。
5）． 有一段時間沒用，或者換了新的流動相，需要先沖洗泵和進樣閥。沖洗泵，直接在泵的出水口，用針頭抽取。沖洗進樣閥，需要在manual菜單下，先點擊purge，再點擊start，沖洗時速度不要超過10 ml/min。
6）． 調節流量，初次使用新的流動相，可以先試一下壓力，流速越大，壓力越大，一般不要超過2000。點擊injure，選用合適的流速，點擊on，走基線，觀察基線的情況。
7）． 設計走樣方法。點擊file，選取se-lect users and methods，可以選取現有的各種走樣方法。若需建立一個新的方法，點擊new method。選取需要的配件，包括進樣閥，泵，檢測器等，根據需要而不同。選完后，點擊protocol。一個完整的走樣方法需要包括：a.進樣前的穩流，一般2-5分鐘；b.基線歸零；c.進樣閥的loading-inject轉換；d.走樣時間，隨不同的樣品而不同。
8）． 進樣和進樣后操作。選定走樣方法，點擊start。進樣，所有的樣品均需過濾。方法走完后，點擊postrun，可記錄數據和做標記等。全部樣品走完后，再用上面的方法走一段基線，洗掉剩余物。
9）． 關液相色譜儀時，先關計算機，再關液相色譜。
10）． 填寫登記本，由負責人簽字。

注意事項：
1）． 流動相均需色譜純度，水用20M的去離子水。脫氣后的流動相要小心振動盡量不引起氣泡。
2）． 柱子是非常脆弱的，*次做的方法，先不要讓液體過柱子。
3）． 所有過柱子的液體均需嚴格的過濾。
4）． 壓力不能太大，不要超過2000 psi。