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多細胞生物的組織分多個層次：

[編輯] 組織和組織系統

更復雜的生物不但擁有分化的細胞和組織，而且也擁有器官，器官是由多個組織組成的、完成特別功能的結構。原始的器官包括扁形動物門動物的腦（由一組神經節細胞組成），大的器官比如加州紅木的莖（可達90米高），復雜和多功能的器官包括脊椎動物的肝。

復雜的生物擁有器官系統，一個器官系統是由多個器官組織在一起來完成相關的功能，而每個器官則集中于一個特定的任務。比如脊椎動物的消化系統由口和食道進食、胃來揉爛和液化食物、胰和膽囊產生和分泌消化酶、腸來將營養吸收入血液。

[編輯] 細胞分化

簡單的多細胞生物如海綿有多種分化的細胞聚集在一起組成。這些分化的細胞包括領細胞（消化細胞）、造骨細胞（結構、支持細胞）、孢子母細胞和扁平細胞（表皮細胞）。雖然這些不同的細胞組成一個有組織的、宏觀的多細胞生物，但是它們并不組成互相連接的組織。假如把海綿切開的話，每個部分可以重新組織，繼續生存，但是假如將不同的細胞分離開來的話它們無法生存。群聚的單細胞生物如綠藻的每個細胞可以在從群聚分離開后繼續生存。

[編輯] 組織

更復雜的生物如缽水母、珊瑚和海葵擁有不同的組織，每個組織由分化的、互相連接的細胞組成，每個組織有特別的功能。比如缽水母的組織包括起保護作用的表皮、起感受作用的神經網，以及起消化作用的胃皮。解剖學的研究課題之一是不同的分化細胞的空間組織。